Además del Comité de Gestión Financiera, del que puede encontrarse mayor información en este enlace, el SisClima cuenta con los siguientes comités:
Comité Técnico: tiene el objeto de asesorar a la Comisión Intersectorial de Cambio Climático (CICC) para garantizar el cumplimiento de las funciones establecidas en el artículo 8° del Decreto 298 de 2016.
Comité de Información Técnica y Científica de Cambio Climático: es el encargado de coordinar las acciones relacionadas con la producción, comunicación y gestión de la información técnica y científica como insumo de los procesos y de la toma de decisiones para la gestión del cambio climático y de las instancias del SisClima.
Comité de Asuntos Internacionales: encargado de la coordinación interinstitucional y orientación estratégica en materia de política exterior en cambio climático y de implementar las recomendaciones respectivas de la CICC.